研究室News

【研究】清水研（東大）との共同研究「TLR3 forms a laterally aligned multimeric complex along double-stranded RNA for efficient signal transduction」がNature communications誌に掲載されました！（プレスリリース） [2023/1/17]
【研究】栗原研（東大）との共同研究「Mandibulofacial dysostosis with alopecia results from gain-of-ET_AR function via allosteric effects on ligand binding」がJournal of Clinical Investigation誌に掲載されました！（プレスリリース）[2023/1/13]
【学生の活躍・研究】星野小百合さん(B4)、吉澤竜哉さん(M1)が第50回構造活性相関シンポジウムにてSAR Presentation Awardを受賞しました！（受賞コメント）[2023/1/11]
【学生の活躍・研究】吉澤竜哉さん(M1)が筆頭著者の論文が「Selective Inhibitor Design for Kinase Homologs Using Multiobjective Monte Carlo Tree Search」としてJournal of Chemical Information and Modeling誌に掲載されました！研究科のHPで紹介されました。[2022/11/24]
【学生の活躍・研究】中川真由子さん(M2)が情報計算科学生物(CBI)学会2022年大会でエクセレントポスター賞を受賞しました! 研究科のHPで紹介されました。 [2022/11/16]
【研究】禾研（横浜市大）との共同研究で、卒業生の下地恵令奈さんの卒業・修士論文研究が、「Hybrid in vitro/in silico analysis of low-affinity protein-protein interactions that regulate signal transduction by Sema6D」としてProtein Science誌に掲載されました！[2022/10/3]
【研究】卒業生大崎和さんの修士論文研究が「3D-RISM-AI: Machine learning approach to predict protein-ligand binding affinity using 3D-RISM」としてThe Journal of Physical Chemistry B誌に掲載されました！ [2022/8/17]
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研究室概要

横浜市立大学生命医科学研究科/理学部生命情報科学研究室では、計算機を用いて、物理化学的分子シミュレーションとバイオインフォマティクスを融合し、タンパク質や核酸 (DNA・RNA) などの生体高分子の立体構造と機能についての理論的研究をしています。また、機械学習や画像処理等の情報科学手法を用いて、創薬・構造生物学を推進する研究、および広く生物・生命現象を解析する研究を行っています。
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生命情報科学研究室は、池口教授グループ及び寺山准教授グループからなり、両グループが協力しながら研究室の教育・研究・運営を行っています。
本研究室は、横浜市立大学理学部の学部生、及び大学院生命医科学研究科の院生を受け入れています。外部から本研究室(大学院)への進学・社会人学生の受け入れも可能です。大学院の入試情報はこちら。

主な参画研究プロジェクト(詳細はこちら)

創薬等先端技術支援基盤プラットフォーム(AMED BINDS)
発動分子科学：エネルギー変換が拓く自律的機能の設計(新学術領域発動分子)
産学連携による次世代創薬AI開発(AMED DAIIA)
プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進(「富岳」成果創出加速プログラム)
- 動的構造機能解析
- AI・シミュレーション融合
堆積物中の時空間的環境動態評価基盤の構築 (JSPS国際共同研究加速B)
過去の大型プロジェクトはこちら

Contact

共同研究や講演等のご依頼・ご相談は池口あるいは寺山(terayama/at/yokohama-cu.ac.jp)までご連絡ください。